Ο Γιάννης Πλούταρχος και η σύζυγός του Μαρία έχουν δημιουργήσει μία πολυμελή οικογένεια με την απόκτησει πέντε παιδιά, την Κατερίνα, τον Γιώργο, την Ελεωνόρα, την Παναγιώτα και τον Κωνσταντίνο.
Τα δύο μεγαλύτερα παιδιά του, ο Γιώργος Κακοσαίος και η Κατερίνα ακολουθούν τη δική τους καριέρα στο τραγούδι. Ο δημοφιλής τραγουδιστής μαζί με τα δύο παιδιά του που έχει συνεργαστεί τόσο δισκογραφικά όσο και σε live εμφανίσεις, φωτογραφήθηκε σε ένα σπάνιο κλικ. Μαζί τους στον φακό πόζαραν η Πέγκυ Ζήνα και ο Λάκης Γαβαλάς.